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ESM3 – Quantensprung für Proteinforschung und Medizin

BY Oliver Welling

Evolutionary Scale, ein führendes Forschungsinstitut im Bereich der Künstlichen Intelligenz, hat mit ESM3 ein bahnbrechendes generatives AI-Modell zur Proteindesign entwickelt. ESM3 simuliert Millionen Jahre Evolution, um neuartige Proteine zu erschaffen. Dieses Modell könnte sowohl die Medikamentenentwicklung als auch die Umweltforschung revolutionieren. Das musst Du wissen ESM3 98 Milliarden Parameter: ESM3 ist das bisher größte Protein-Sprachmodell. Trillionen Teraflops: Unglaubliche Rechenleistung dank NVIDIA H100 GPUs und dem Andromeda-Cluster. Vielfältige Datensätze: Training auf 2,78 Milliarden Proteinsequenzen aus unterschiedlichen Organismen und Biomen. Interaktive Protein-Generierung: Ermöglicht maßgeschneiderte Proteindesigns basierend auf spezifischen Anforderungen. Selbstverbesserung: Das Modell kann sich basierend auf Feedback weiterentwickeln und optimieren. ESM3 nutzt fortschrittliche Selbstüberwachungsmechanismen und integrierte Fehlerkorrektur, um kontinuierlich die Genauigkeit seiner Vorhersagen und Designs zu verbessern. ESM3: Das größte Protein-Sprachmodell Mit 98 Milliarden Parametern und einer Datenbasis von 2,78 Milliarden Proteinsequenzen setzt ESM3 neue Maßstäbe in der Proteinmodellierung. Durch die Integration von Sequenz-, Struktur- und Funktionsannotationen als Eingaben erreicht das Modell eine bisher unerreichte Genauigkeit bei der Proteinidentifikation und -validierung. Unterstützt von einer enormen Rechenleistung von einer Billion Teraflops übertrifft ESM3 alle bisherigen biologischen Modelle. GFP-Variante: Evolution in Sekunden ESM3 hat eine neue Variante des Green Fluorescent Protein (GFP) erzeugt, eine Leistung, die in der Natur 500 Millionen Jahre dauern würde. Dieses neuartige GFP, das eine 58%ige Abweichung zum nächsten bekannten fluoreszierenden Protein aufweist, wurde in einem Bruchteil der Zeit erschaffen und zeigt das Potenzial von ESM3, wissenschaftliche Forschung erheblich zu beschleunigen. Anwendung in Wissenschaft und Industrie ESM3 bietet vielfältige Anwendungsmöglichkeiten, von der Medikamentenentwicklung bis zur Umwelttechnologie. In der Pharmakologie kann das Modell neuartige Proteine erzeugen, die die Entwicklung neuer Therapeutika und Antikörper beschleunigen. Auch für ökologische Anwendungen wie die Entwicklung von Proteinen zur Kohlendioxidbindung oder Enzyme zur Zersetzung schädlicher Kunststoffe bietet ESM3 großes Potenzial. Es agiert als virtueller Mitarbeiter, der Forscher bei der Lösung komplexer biologischer Herausforderungen unterstützt. Zu den bisherigen Erfolgen von ESM3 gehört die Beschleunigung der Entwicklung von Therapeutika und die Schaffung neuer Enzyme zur Abfallreduktion. Zusammenarbeit und Finanzierung Dank Partnerschaften mit Amazon Web Services (AWS) und NVIDIA wird die Zugänglichkeit und Weiterentwicklung von ESM3 gesichert. AWS stellt das Modell einer breiten Forschergemeinschaft zur Verfügung, darunter führenden Pharmaunternehmen. NVIDIA optimiert ESM3 für höchste Trainings- und Leistungsfähigkeit. Mit einer Finanzierung von über 142 Millionen Dollar von Investoren wie Lux Capital, Amazon und NVentures wird die Weiterentwicklung von ESM3 vorangetrieben. ESM3 ist in NVIDIA BioNeMo integriert, was optimierte Performance und erweiterte Funktionalitäten für Biowissenschaften und Medikamentenentwicklung ermöglicht. Fortschrittliche Recheninfrastruktur ESM3 nutzt eine hochmoderne Recheninfrastruktur, um seine beispiellosen Fähigkeiten zu realisieren. Die NVIDIA H100 GPUs und der Andromeda-Cluster sorgen für die erforderliche Rechenleistung, um komplexe Proteinstrukturen zu modellieren und neue Proteine zu entwerfen. Der Andromeda-Cluster ist ein hochmoderner Supercomputer, der speziell für Startups entwickelt wurde, um umfangreiche Experimente, Trainingsläufe und Inferenzprozesse durchzuführen. Mit einer beeindruckenden Leistung von 15 Exaflops ist Andromeda in der Lage, enorme Datenmengen in kürzester Zeit zu verarbeiten, was ihn ideal für fortschrittliche AI-Modelle wie ESM3 macht. Spezifikationen Andromeda Cluster: 3,200 NVIDIA H100 GPUs auf 400 Nodes, verbunden durch 3,2 Tbps Infiniband 432 NVIDIA H100 GPUs auf 54 Nodes, ebenfalls verbunden durch 3,2 Tbps Infiniband 768 NVIDIA A100 GPUs für Training und Inferenz mit 1,6 Tbps Infiniband Speichermöglichkeiten: Lokale Speicherung auf NAS oder Streaming ohne Ingress/Egress-Kosten Flexibilität: Keine Mindestnutzungsdauer und hervorragende Preisgestaltung Gesamtmasse: 4,862 kg (nur GPUs, ohne Gehäuse, System, Rack) Training: Groß genug, um ein Llama 65B Modell in einer Woche zu trainieren Alexander Rives, Mitbegründer und leitender Wissenschaftler bei EvolutionaryScale, betont, dass ESM3 den Weg für eine Zukunft ebnet, in der Biologie programmierbar wird und AI als Werkzeug dient, um von Grund auf neue Strukturen und Mechanismen zu entwickeln. ESM3 – Auswirkungen auf die Forschung ESM3’s Erfolg bei der Generierung eines neuen GFP unterstreicht das Potenzial des Modells für Fortschritte in der biologischen Forschung und den Lebenswissenschaften. EvolutionaryScale stellt ein API für eine geschlossene Beta-Version und den offenen Zugang zu einem kleineren Modell für nicht-kommerzielle Zwecke zur Verfügung. Fazit ESM3 Mit der Einführung von ESM3 steht der Wissenschaft ein mächtiges Werkzeug zur Verfügung, das die Proteinforschung und -entwicklung auf ein neues Niveau hebt. Die Kombination von enormer Rechenleistung und präzisen Modellierungsfähigkeiten bietet die Chance, wissenschaftliche Durchbrüche zu beschleunigen und globale Herausforderungen in der Medizin und Umwelttechnologie anzugehen. #Proteinforschung #KünstlicheIntelligenz #ESM3 #EvolutionaryScale #Biotechnologie #Medikamentenentwicklung #Umweltschutz #NVIDIA #AWS BioPharmaTrend: EvolutionaryScale Unveils ESM3 Generative AI Model for Advanced Protein Design Evolutionary Scale Amazon NVIDIA

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